יש לנקות את הלוח הפלקסוגרפי מיד לאחר ההדפסה במכונת דפוס הפלקסו, אחרת הדיו יתייבש על פני לוחית ההדפסה, דבר שקשה להסירו ועלול לגרום ללוחות רעים. עבור דיו המבוסס על ממס או דיו UV, השתמש בממס מעורב (כגון אלכוהול) בריכוז נמוך יותר התואם לצלחת לניקוי. עבור דיו על בסיס מים, ניתן לנקות אותו עם חומר ניקוי נוזלי אלקליין או תמיסת ניקוי ברמה גבוהה להדפסה פלקסוגרפית. ואל תשתמש במברשת קשה כדי למנוע שריטות על לוחית ההדפסה. לאחר הכביסה יש לייבש את לוחית ההדפסה בחתיכת בד נטולת מוך, להקפיד לא לשפשף שוב ושוב את לוח ההדפסה ולאטום אותה לשימוש מאוחר יותר לאחר הייבוש. יש לנקות את הלוח הפלקסוגרפי מיד לאחר ההדפסה, אחרת הדיו יתייבש על פני לוח ההדפסה, דבר שקשה להסירו ועלול לגרום לצלחת פגומה. עבור דיו המבוסס על ממס או דיו UV, השתמש בממס מעורב (כגון אלכוהול) בריכוז נמוך יותר התואם לצלחת לניקוי. עבור דיו על בסיס מים, ניתן לנקות אותו עם חומר ניקוי נוזלי אלקליין או תמיסת ניקוי ברמה גבוהה להדפסה פלקסוגרפית. ראוי לציין כי בעת הניקוי יש לנגב אותו בעדינות עם מטלית כותנה רכה, ואל תשתמש במברשת קשה כדי למנוע שריטות על לוח ההדפסה. לאחר הכביסה יש לייבש את לוחית ההדפסה בחתיכת בד נטולת מוך, להקפיד לא לשפשף שוב ושוב את לוח ההדפסה ולאטום אותה לשימוש מאוחר יותר לאחר הייבוש.